Grupa za molekularnu biologiju
srijeda, 21. veljaèa 2007. godine u 18.00 sati predavaonica B02 (MB1)
Prirodoslovno-matematièkog fakulteta, Rooseveltov trg 6, Zagreb

Dr.sc. Ksenija Zahradka
Laboratorij za molekularnu mikrobiologiju
Zavod za molekularnu biologiju
Institut Ruðer Boškoviæ

Preživljenje bakterije Deinococcus radiodurans  u ekstremnim uvjetima: spašavanje rekombinacijom

Bakterija Deinococcus radiodurans pripada skupini ekstremofila, organizama koji mogu preživjeti ekstremne uvjete, npr. isušivanje u pustinjskom pijesku ili na golim stijenama. Prilagodba na isušivanje omoguæila je ovoj bakteriji i izuzetnu otpornost na zraèenje. I ekstremno isušivanje i zraèenje izazivaju najteži tip ošteæenja u stanici – cijepaju genom u stotine fragmenata. U samo nekoliko sati ti se fragmenti u bakteriji D. radiodurans sklapaju u funkcionalni kromosom zahvaljujuæi iznimno uèinkovitom i preciznom popravku DNA. Pronašli smo da se taj popravak odvija u dva koraka. Prvi korak ovisi o DNA polimerazi I, a ukljuèuje sparivanje dugaèkih novosintetiziranih jednolanèanih krajeva DNA (engl. extended synthesis-dependent strand annealing, ESDSA). Mali fragmenti DNA nastali zraèenjem povezuju se procesom ESDSA u dugaèke linearne intermedijere. U drugom koraku, ti se intermedijeri sklapaju u funkcionalne kružne kromosome RecA-ovisnom homolognom rekombinacijom. Popravljeni kromosomi predstavljaju mozaik sastavljen od starih (sintetiziranih prije zraèenja) i novih (sintetiziranih nakon zraèenja) dvolanèanih blokova DNA.

Predsjednica HGD-a:
Dr. sc. Ðurðica Ugarkoviæ, zn. savjetnica, IRB

Koordinatori predavanja:
Dr. sc. Ksenija Zahradka, zn. sur., IRB
Dr. sc. Krešimir Gjuraèiæ, GSK Research Centre Zagreb Ltd.