srijeda, 7. ožujka 2007. godine u 18.00 sati
predavaonica B02 (MB1)
Prirodoslovno-matematičkog fakulteta, Rooseveltov trg 6, Zagreb

Poziv na dodjelu nagrade za mlade istraživače u području molekularne biologije
 
NAGRADA ŽELJKO TRGOVČEVIĆ

Nagradu za 2006. godinu dobila je dr. sc. Silvija Bilokapić
                           
Nakon uručenja nagrade bit će održano predavanje :

Dr. sc. Silvija Bilokapić
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zavod za biokemiju

Uloga cinkovog iona u aktivnom mjestu atipične arhealne seril-tRNA-sintetaze: strukturna i biokemijska analiza

Aminoacil-tRNA-sintetaze skupina su enzima koji imaju ključnu ulogu u osiguravanju vjernosti biosinteze proteina na ribosomu. Seril-tRNA-sintetaze (SerRS) su odgovorne za sintezu seril-tRNA^Ser.
Filogenetska analiza na osnovi primarnih sljedova aminokiselina pokazala je razdiobu SerRS u dvije evolucijski udaljene grupe: bakterijski i metanogeni tip enzima. Bakterijski tip SerRS pronađen je u većini organizama, dok je metanogeni tip pronađen u metanogenih arhebakterija.
Rekombinantna SerRS iz arheje Methanosarcina barkeri pročišćena je iz bakterije Eschericia coli i utvrđeni su uvjeti za kristalizaciju apo-enzima. Struktura metanogenog tipa SerRS riješena je i u kompleksu sa: serinom, ATP, te stabilnim analogom seril-adenilata, 5’-O-(N-(L-seril)sulfamoil)adenozinom. Ion cinka, otkriven u aktivnom mjestu ezima, direktno je uključen u mehanizam selekcije pripadne aminokiseline. Rješavanjem strukture utvrđeno je da SerRS metanogenih arheja posjeduju novu domenu za vezivanje tRNA^Ser, te jedinstvenu inserciju unutar katalitičke domene. Uloga ove insercije podrobnije je istražena. Rezultati su pokazali da jedinstvena insercija unutar katalitičke domene metahogenog tipa SerRS ima bitnu ulogu u prostornom usmjeravnju i pozicioniranju N-terminalne domene.