Grupa za molekularnu biologiju
srijeda, 28. ozujka 2007. godine u 18.00 sati predavaonica B02 (MB1)
Prirodoslovno-matematickog fakulteta, Rooseveltov trg 6, Zagreb

Dr. sc. Tomislav Domazet-Loso
Laboratorij za molekularnu genetiku eukariota
Zavod za molekularnu biologiju
Institut Rudjer Boskovic

Genomska filostratigrafija - novi pristup u makroevolucijskim istrazivanjima

Filogenomika, presjek izmedju genomike i evolucije je nova disciplina za koju se ocekuje da ce omoguciti novi uvid u u bioloske sisteme. Na primjer, teorija evolucije genoma “konstrukcijskom selekcijom“ predvidja da svojstva gena u danasnjim organizmima barem dijelom reflektiraju selekcijske rezime koji su djelovali tijekom nastanka tih gena u evolucijskoj proslosti. S druge strane studije gena bez podrijetla (“orphan genes“) ukazuju na nacin kako testirati prije navedenu hipotezu, koja ako je tocna odmah otvara novi pristup rekonstrukciji adaptivne evolucijske povijesti organizama.
Ipak, usprkos dostupnosti odgovarajucih podataka gore navedena predikcija nije testirana. U ovom izlaganju pokazujem, koristeci genomske i ekspresijske podatke vinske musice, da je grupiranjem gena ovisno o njihovom evolucijskom nastanku moguce otkriti otiske vaznih adaptivnih dogadjaja u evolucijskoj povijesti zivotinja.
Nadalje pokazujem da su embrionalni zametni listici evoluirali u ektoderm-endoderm-mezoderm progresiji, a isto tako i da su se adaptacije koje su omogucili novonastali geni uglavnom dogadjale u ektodermu. Uocljiva i znacajna iznimka u tom trendu je evolucijska linija koja vodi nakon diverzifikacije Eumetazoa do zadnjeg zajednickog pretka bilateralno simetricnih zivotinja gdje novonastali geni podjednako pridonose aktivnosti sva tri embrionalna zametna listica. U istom medjucvoru detektirao sam i iznimnu fiksaciju novih gena koja upucuje da je jedinstvena erupcija u genomu prethodila Kambrijskoj ekspoziji kao najznacajnijoj diverzifikaciji u evoluciji zivotinja.
Prezentirani rezultati imaju utjecaj na razumjevanje makroevolucijskih procesa kod zivotinja, medjutim predstavljeni pristup rekonstrukcije adaptivne evolucijske povijesti, koji nazivam genomska filostratigrafija, moze biti isto tako uporabljen u bilo kojoj evolucijskoj liniji.

Predsjednica HGD-a:
Dr. sc. Djurdjica Ugarkovic, zn. savjetnica, IRB

Koordinatori predavanja:
Dr. sc. Ksenija Zahradka, zn. sur., IRB
Dr. sc. Kresimir Gjuracic, GSK Research Centre Zagreb Ltd.