Grupa za molekularnu biologiju
srijeda, 16. svibnja 2007. godine u 18.00 sati predavaonica B02 (MB1)
Prirodoslovno-matematickog fakulteta, Rooseveltov trg 6, Zagreb

Dr. Vanja Klepac-Ceraj, Ph.D.
Harvard Medical School, Dept. Microbiology and Molecular Genetics,
Boston, MA, SAD

Prozor u mikrobnu raznolikost

Molekularnim studijama je pokazano da su mikrobne zajednice izuzetno raznolike.  No, sam pojam mikrobne raznolikosti jos uvijek nije do kraja definiran jer nam nedostaju odgovori na temeljna pitanja poput:  Koliko bakterijskih vrsta zivi zajedno u odredjenoj mikrobnoj zajednici? i, Da li te vrste formiraju filogenetski zasebne jedinice odredjene ekoloske vrijednosti?  Kako vecinu mikroorganizama jos uvijek nije moguce uzgajati u laboratoriju, odgovore na pitanja vezane uz bakterijsku raznolikost sam istrazivala metodama molekularne biologije, tocnije analizom velikih knjiznica sekvenci 16S rRNA gena dobivenih direktno iz uzoraka zajednice obalnog bakterioplanktona (sjeverozapadnog Atlantika). 16S rRNA gen se cesto koristi za dobivanje tzv. “otisaka prstiju” pojedinacnih mikrobnih tipova. Jedna od najznacajnih spoznaja proizaslih iz ovog istrazivanja je da vecina sekvencija iz iste mikrobne zajednice pripada skupinama s mikro razlikama, koje se razlikuju u <1% sekvence. Slican profil mikroraznolikosti dobiven je i detaljnom analizom pojedinih gena i genoma bakterija koje pripadaju Vibrio splendidus, izoliranih iz iste zajednice obalnog bakterioplanktona. Smatramo da su skupine mikroraznolikosti bitne jedinice diferencijacije u prirodnim bakterijskim zajednicama.  Nasa hipoteza je da te skupine nastaju putem selektivnih «cistki» i da sadrze visoku raznolikost zato sto su kompetitivni mehanizmi preslabi da bi izbrisali raznolikost unutar skupina. Ovaj rezultat se ne uklapa u trenutno shvacanje pojma bakterijskih vrsta, te zahtijeva preispitivanje same definicije mikrobnih vrsta. Potrebna su dodatna istrazivanja kako bi utvrdili do koje granice se ta raznolikost odrazava na ekoloski diferencirane populacije (tj. grupe mikroorganizama koje na promjene u okolisu reagiraju kao jedinke).

Predsjednica HGD-a:
Dr. sc. Djurdjica Ugarkovic, zn. savjetnica, IRB

Koordinatori predavanja:
Dr. sc. Ksenija Zahradka, zn. sur., IRB
Dr. sc. Kresimir Gjuracic, GSK Research Centre Zagreb Ltd.